植物基因组学国家重点实验室平台建设的主要目标和任务是：根据国家农业生物技术发展和植物分子生物学研究的重大战略需求，建设配套完善、技术先进、功能齐全和开放共享的植物基因组学研究分析平台，为农业基础与应用研究提供有力的支撑与保障。

目前，植物基因组学国家重点实验室建筑面积8520平方米，基本满足科研用房需求。在财政部、科技部、国家自然科学基金委员会和中科院的大力支持下，实验室已拥有包括高通量测序仪、扫描电子显微镜、超薄/半薄切片机、基因枪、Real-Time PCR仪、多功能分子成像系统和激光共聚焦显微系统等在内的各种大型设备近20台，建立了完善的公共研究平台，管理实现制度化，规范化，基本满足从形态到分子水平不同层次的科研工作需求。同时实验室为满足植物材料培养实验要求，拥有配套温室等实验设施。实验室管理人员承担和维护实验室日常运行工作，包括实验室公用设备和仪器的日常运转和维修工作。